ANÁLISE COMPARATIVA DAS VIAS DE METABOLISMO DE ÁCIDO SIÁLICO EM BACTÉRIAS EM DADOS DE SEQUENCIAMENTO DE DOENÇAS INFLAMATÓRIAS INTESTINAIS E INFECÇÃO POR Clostridioides difficile.

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Publicado: abr. 1, 2026
Palavras-chave:
Ácido siálico, Aprendizado de Máquina, Bioinformática, metagenômica

Conteúdo do artigo principal

DORIVALDO MARQUES DA SILVA JUNIOR
IFSP
Tiago Cabral Borelli
USP
Dra. Livia Soares Zaramela
USP
Rafael Garcia Leonel Miani
IFSP Votuporanga

Resumo

As doenças inflamatórias intestinais (IBD) e a infecção por Clostridioides dificile (CDI)
são condições graves em expansão em diversas regiões do planeta, ambas associadas à disbiose da
flora intestinal. Na dinâmica intestinal, os ácidos siálicos, grupo de monossacarídeos carboxilados
encontrados na extremidade de biomoléculas na superfície celular, que participam de processos
patológicos, apresentam grande relevância biológica. Esses açúcares atuam como sítios de ligação para
patógenos e toxinas. Dessa forma, justifica-se a investigação do papel de proteínas bacterianas
relacionadas ao metabolismo de ácidos siálicos nessas doenças. Dados passíveis dessa análise se
encontram disponíveis publicamente, mas não foram estudados com esse enfoque. Este estudo teve
como objetivo analisar as proteínas relacionadas ao metabolismo de ácidos siálicos, buscando
associações com as condições citadas. Para tanto, dados metagenômicos obtidos do banco de dados
Sequence Read Archive (SRA) e do European Nucleotide Archive (ENA) foram processados utilizando
ferramentas de bioinformática, quantificando-se a abundância dos respectivos genes na microbiota.
Por fim, foram utilizados testes estatísticos e aprendizado de máquinas para avaliar as associações,
observando-se significância (p-valor < 0.01) para 19 proteínas para CDI e 4 para IBD, o que sustenta a
importância dessa molécula na dinâmica dessas patologias.

Detalhes do artigo

Edição
v. 16 n. 1 (2025): CONICT - Congresso de Inovação, Ciência e Tecnologia do IFSP
Seção
Artigos
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Este trabalho está licenciado sob uma licença Creative Commons Attribution-NonCommercial 4.0 International License.

Biografia do Autor

DORIVALDO MARQUES DA SILVA JUNIOR, IFSP

Graduação em andamento em Sistemas de Informação no Instituto Federal de São Paulo de Votuporanga. Possui graduação no curso de Bacharelado em Biotecnologia pela Universidade Federal de São Carlos (2013) , com período sanduíche na University of California, Davis. Atuei nos seguintes temas: análises genéticas de camarões marinhos e peixes de água doce, genética de microrganismos e virologia de planta. Atualmente atuo com bioinformática, analisando dados metagenômicos no contexto de doenças inflamatórias intestinais.

Tiago Cabral Borelli, USP

Formado em Ciências Biológicas pela Faculdade de Filosofia da Universidade de São Paulo (FFCLRP USP). Mestre pelo programa de pós graduação em Biologia Comparada da Faculdade de Filosofia da Universidade de São Paulo (FFCLRP USP) onde desenvolvi um projeto de pesquisa em bioinformática comparando genomas de bactérias em busca de padrões na evolução de genes de resistência a antibióticos. Atualmente, sou aluno de doutorado na Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto (FMRP-USP) e desenvolvo modelos de deep learning para identificar restrições adaptativas na evolução de genes de resistência

Dra. Livia Soares Zaramela, USP

Bacharel em Bioquímica pela Universidade Federal de Viçosa (2009). Mestre em Genética e Melhoramento de plantas pela Universidade Federal de Viçosa (2011). Doutorado em Bioquímica pela Universidade de São Paulo, Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto (2015). Pós-doutorado pela University of California San Diego (2016-2021). Assistente de Projetos Científicos pela University of California San Diego (2021-2022). Professora Doutora do Departamento de Bioquímica e Imunologia da Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto na Universidade de São Paulo. Busca compreender complexas interações entre microrganismos, o ambiente e seus hospedeiros. Para tal, utiliza-se de uma abordagem multidisciplinar integrando microbiologia, biologia molecular, genética e biologia computacional. Nos últimos anos tem buscado compreender o impacto de processos inflamatórios da microbiota do intestino e na pele humana. Tem especial interesse no papel de ácidos siálicos na interação entre microrganismos e hospedeiro. (Texto informado pelo autor)