DESENVOLVIMENTO DE FERRAMENTAS COMPUTACIONAIS PARA A INVESTIGAÇÃO DA CONDUÇÃO QU NTICA EM PROTEÍNAS

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Daniel Castilho
Filipe C. Dalmatti

Resumo

A compreensão dos princípios fundamentais que regem o movimento dos elétrons nas proteínas ainda apresenta muitas questões em aberto, que estão sendo gradualmente exploradas no contexto científico. Uma técnica utilizada para o estudo da condução quântica de proteínas é a microscopia de tunelamento (STM), que visa identificar as regiões mais sensíveis à passagem de elétrons. No entanto, o estudo desses mecanismos pode ser aprimorado com o uso de ferramentas computacionais que auxiliem na interpretação dos experimentos. Estamos desenvolvendo um software para apoiar os resultados experimentais de STM, modelando potenciais regiões tridimensionais de proteínas a partir de dados do Protein Data Bank (PDB). O código está sendo escrito em Python 3 e incorpora funções de busca de resíduos de aminoácidos, utilizando uma abordagem interdisciplinar que combina geometria analítica, bioquímica e banco de dados. Além disso, os resultados são integrados para visualização imediata no software de código aberto Pymol. Os resultados indicam a formação de grids de seleção das regiões das proteínas, que foram validados por meio de planilhas e verificação por debug. As próximas etapas deste trabalho em andamento incluem a correlação com medidas experimentais de tunelamento eletrônico. Espera-se que essas informações inéditas contribuam significativamente para o avanço no desenvolvimento de biossensores e dispositivos nanotecnológicos, além de oferecer novas compreensões sobre os mecanismos que regulam a condução quântica em proteínas.

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